Bouwinvest heeft een directie die bestaat uit een statutair directeur, tevens voorzitter van de directie, en drie managing directors: de financieel directeur, de directeur Nederland en de directeur Internationale Investeringen. De statutair directeur wordt benoemd door de Algemene Vergadering van Aandeelhouders op voordracht van de Raad van Commissarissen van Bouwinvest. De directie heeft een reglement waarin taken en verantwoordelijkheden zijn omschreven.